Na rezonans wydasz sporo pieniędzy a wcale nie jest powiedziane, że cokolwiek wykaże. Na pewno nie szłabym na rezonans bez wcześniejszej konsultacji z lekarzem, w Twoim przypadku chyba z ortopedą. A jeśli dużo biegasz i bolą Cię nogi to może problem jest w butach do biegania albo w częstotliwości treningów. Nie wiem w czym biegasz i po jakiej nawierzchni ale poczytaj trochę o amortyzacji w butach biegowych itd. Unikaj biegania po betonie (kostka brukowa itd), mi się najlepiej biega po takich polnych czy leśnych drogach aczkolwiek jesienią i zimą jest z tym problem (błoto, woda itd). Poszukaj sobie porządnych butów dopasowanych do nawierzchni, po której biegasz, zobacz sobie np tu są czasem ciekawe promocje na buty biegowe:
http://allsports.pl/biegowe/318/produkty albo jak mieszkasz w większym mieście to idź do jakiegoś specjalistycznego sklepu dla biegaczy.